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征稿

本文摘要:征稿|组学技能:中草药配方机理研究的重要东西 来历 TMR Publishing Group 作者 Traditional Medicine Research 编辑部 从天然中草药中判定活性身分并展示其潜在机制是中药范畴研究的关键。比年来,越来越多的研究集中在中草药配方的感化和机制上,按照几千年来的临床经验,这些 配方的基础研究与中医的理论和实际应用进一步吻合。

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征稿|组学技能:中草药配方机理研究的重要东西 来历 TMR Publishing Group 作者 Traditional Medicine Research 编辑部 从天然中草药中判定活性身分并展示其潜在机制是中药范畴研究的关键。比年来,越来越多的研究集中在中草药配方的感化和机制上,按照几千年来的临床经验,这些 配方的基础研究与中医的理论和实际应用进一步吻合。单化合物具有特定的分子布局,因此,它们的有效方法和机制研究在西方和东方药物中都是相似的,使它们更能为世界各地的研究人员所接管。相反,中药配方的多组分、多靶点和多径路使得精确摸索其机制具有挑战性,在西医研究中使用的通例方法将不合用,这是研究人员不能接管中草药配方的主要原因,并对中医的现代化发生巨大障碍。

跟着中医基础研究的快速进展,科技创新在中医方面取得了冲破。组学技能、基因组学 、转录组学 、卵白质组学 、代谢组学等现代生物研究系统中基于高通量阐发和检测技能的一系列研究方法,对数千个靶点和通路举行评估,而不是聚焦于单一的靶点或通路,可以筛选生物信号转导历程中涉及的基因,卵白质,代谢物和其他因子的整体变化。这与中医的“整体观”理论是一致的,它全面地解释了中草药配方的总体机制。

在本研究中,我们先容了传统使用的组学技能及其在中草药配方机理研究中的应用。基因组学和转录组学技能 基因组学和转录技能,包括基因微阵列和高通量测序,涉及所有基因转录及其对细胞程度的调控。基因组学是第一种发财的组学技能,可以筛选药物干预前后的整个基因变化,而转录组学更有可能存眷转录后的总RNA。

转录组学发生的数据量小于基因组学发生的数据量,使其更容易阐发。今朝,转录组学在体内和体外遍及应用于具有或不具有中医治疗的差异表达基因的判定。

高通量测序是阐发高通量基因表达谱的有力东西。关键基因是通过度析差异表达基因的彼此感化得到的,通过GO和KEGG阐发可以确定受药物干预影响的主要途径。Wang等人,接纳高通量测序技能筛选中成药芪参益气对急性心肌梗死的多方面治疗效果)。一般环境下, 芪参益气治疗后,在大鼠 急性心肌梗死模型中判定出2,733个差异表达基因,包括1,344个上调基因和1,389个下调基因。

进一步的KEGG阐发和尝试验证表白,花生四烯酸LOX途径、一氧化氮生成和脂肪酸氧化可能是 芪参益气对 急性心肌梗死的潜在机制。基因微阵列评估细胞和器官的表观遗传调控。表观遗传学技能的重点是不涉及DNA序列变化的基因功效的改变。除了DNA和RNA序列的变化外,还发明了几种调治基因在组织和细胞中“打开”和“封闭”的调控方法,如DNA甲基化、组卵白修饰、MIRNA、INCRNA和CIRCRNA。

DNA甲基化已被遍及研究以调治靶基因的转录。DNA甲基化异常与冠心病有关,中成药养心通脉可影响ZEB2基因甲基化治疗。miRNA是一种小的单链RNA分子,介入了很多生理和病理历程。中草药配方中的活性身分对miRNA具有遍及的调控感化,研究miRNA为中医机制的摸索开发了新的范畴。

别的,比年来,IN CRNAs和CIRC RNAs在康健和疾病中的感化也获得了遍及的研究。调制lncRNA和circRNA是界定中草药配方表观遗传调控机制和靶点的一种新的研究方法。Dai等人。

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用MIRNA芯片研究QS YQ滴丸对缺血性心脏病的感化机制。成果表白,QS YQ通过调治mir-223-3p和RPS6K B1/HIF-1α信号通路的表达,可促进缺血性心脏微血管内皮细胞的血管生成。

卵白质组学技能 展开全文 代谢组学 代谢组学是继转录组学和卵白质组学之后成长起来的一种新技能;它应用先进的检测技能、阐发方法和统计较法对生物或细胞中的整体代谢物举行定量和定性阐发。代谢产品是低分子量的生物分子,在各类生物历程中可以充当信号分子、能量来历和代谢载体。代谢组中的程度可能受基因组、转录组和卵白质组协同感化的影响,直接反应器官或细胞当前的代谢状态。因此,代谢体也被称为特定细胞或器官的分子表型。

与转录组和卵白质组比拟,代谢物数据库更简朴,更容易被理解。别的,基因和卵白质表达的微小变化可以在代谢物程度上放大,使这项技能越发系统、直观和敏感。非靶向代谢组学阐发表白,经验富厚的处方补脏通络方可以通过调治脂质、谷氨酰胺和色氨酸代谢途径来减轻糖尿病血管功效障碍。肠道微生物 肠道微生物的稳态与几个生理和病理的生物历程密切相关。

肠道微生物干预,如饮食治疗、益生菌和粪便移植,为疾病的治疗提供了新的见解。由于大大都中草药配方是口服给患者的,而且有几种身分显示出低的生物操纵度,调治肠道微生物群正日益成为展现中草药配方机制的重要途径。16SrRNA测序和元组学可以阐发肠道微生物多样性的变化,筛选药物干预前后失调的肠道微生物。经典的古代方子痛泻药方可以通过影响肠中Akkermansia和sortridiumsensusurto1的品貌来缓解肠易激综合征,调治5-HT程度。

Huan-Tian Cui, Lu Yang, Yu-Ting Li, et al. Omics technology: an important tool in mechanism studies of Chinese herbal formulas. Traditional Medicine Research 2020, online. doi: 10.12032/TMR20200920199 官网: https://www.tmrjournals.com/tmr 投稿地址:https://submission.tmrjournals.com/submission?journal=18返回,检察更多。


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